Το Τμήμα Αλλοδαπών και Μορφωτικών Ανταλλαγών αποτελεί μία από τις δύο οργανικές Μονάδες της Διεύθυνσης Ειδικών Προγραμμάτων Διεθνών Υποτροφιών.

Το Τμήμα έχει τις ακόλουθες αρμοδιότητες:

• Διαχειρίζεται τις υποτροφίες που χορηγούνται σε ξένους υπηκόους.

• Εκτελεί τις εντολές πληρωμής των Τμημάτων του Υ.ΠΑΙ.Θ.Π.Α. τα οποία διαχειρίζονται υποτροφίες που χορηγούνται σε ξένους υπηκόους.Τμήμα αυτών αποτελούν και οι Μορφωτικές Ανταλλαγές που υλοποιούνται με βάση τις μορφωτικές συμφωνίες που υπογράφονται με ξένα κράτη και αφορούν ανταλλαγή καθηγητών, επιστημόνων-ερευνητών και σπουδαστών.

• Καταβάλει δαπάνες που αφορούν υποτροφίες σε ξένους υπηκόους των θερινών προγραμμάτων Υποτροφιών ΘΥΕΣΠΑ και ΙΑΣΩΝ που διαχειρίζονται  το Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών και το Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης αντίστοιχα.

• Διαχειρίζεται το Διμερές Πρόγραμμα προώθησης των ανταλλαγών και της επιστημονικής συνεργασίας μεταξύ Ελλάδας και Γερμανίας.

• Το ΙΚΥ υλοποιεί το πρόγραμμα υποτροφιών για ξένους υπηκόους προς παρακολούθηση μαθημάτων και σεμιναρίων στην Ελληνική Γλώσσα και τον Πολιτισμό από το 1992, μετά από προτάσεις που του υπέβαλαν τα ελληνικά πανεπιστήμια, προκειμένου να δοθεί η δυνατότητα σε ξένους υπηκόους να σπουδάσουν την ελληνική γλώσσα, είτε για να φοιτήσουν σε ελληνικά Πανεπιστήμια, είτε για να τη διδάξουν στη χώρα τους.  

Το Τμήμα συνεργάζεται με φορείς όπως: Υπουργεία (ιδίως Υ.ΠΑΙ.Θ.Π.Α., ΥΠΕΞ), Ελληνικές Διπλωματικές Αρχές, Ξένες Διπλωματικές Αρχές στην Ελλάδα, Διεθνείς Οργανισμούς, Πανεπιστήμια και Ιδρύματα, ΔΟΑΤΑΠ, ξένους φορείς διαχείρισης υποτροφιών, Διεύθυνση Αστυνόμευσης Αερολιμένα Αθηνών, Εθνικό Ίδρυμα Νεότητας, Διευθύνσεις Αλλοδαπών και Μετανάστευσης Περιφερειών ή Διοικήσεων της Ελλάδας και συναλλάσσεται καθημερνά με πολίτες (ξένους και Έλληνες).